CDS
Accession Number | TCMCG023C16965 |
gbkey | CDS |
Protein Id | PIN10262.1 |
Location | complement(join(6510..6548,7732..7887,8627..8830,8928..9131,9791..10000,10152..13526,13632..13783,14091..14586,15440..16139,16322..17439)) |
Organism | Handroanthus impetiginosus |
locus_tag | CDL12_17145 |
Protein
Length | 2217aa |
Molecule type | protein |
Topology | linear |
Data_file_division | PLN |
dblink | BioProject:PRJNA324125, BioSample:SAMN05195323 |
db_source | NKXS01003272.1 |
Definition | hypothetical protein CDL12_17145 [Handroanthus impetiginosus] |
Locus_tag | CDL12_17145 |
EGGNOG-MAPPER Annotation
COG_category | S |
Description | Ribosome 60S biogenesis N-terminal |
KEGG_TC | - |
KEGG_Module | - |
KEGG_Reaction | - |
KEGG_rclass | - |
BRITE |
ko00000
[VIEW IN KEGG] ko01000 [VIEW IN KEGG] ko03009 [VIEW IN KEGG] |
KEGG_ko |
ko:K07766
[VIEW IN KEGG] ko:K14861 [VIEW IN KEGG] |
EC |
3.6.1.52
[VIEW IN KEGG]
[VIEW IN INGREDIENT] |
KEGG_Pathway | - |
GOs | - |
Sequence
CDS: ATGGAAGAAAAGGAAGAGCAAGACCTTCCAGAATTTACTATTAGAATGAACCACGAAGCAAAGCTCAAAGAACTCCTCCGCAACTTAAACTCCGTTGAATCACAGCTCTTTTCCGACGCCTGCAAAGAGTTCATCAAAATCCTAAAATCTGATTCGGGCCCTCAATTTATACGTATTTATGTTCAGACATCCTCCAAACTTGTTGAAATTTCCCAAGCTTGGGAATTTCGCAAAGGTAAACCCGGGTTTTTGCATATATTGAACTTAGTTGCTTCAGTTTTGAAGCATTGGAAGGATAATGTGGTTAGTGATGGTGGCGTTGCTATTCGTCAGGCGTTGGATAGGTTTGCGCGGACGGTTTTTGAGGAGAAGATGGGGGATTTATATAAGGAGTTGAATAGTAAAGAGGCCAAGAGACAGAATGCTGTTCTTTTGTTGTTGGCCTCTATTGTTAGGCGTAATTCACATTTGGCATGGGAAGTGGCAAAGGTTTTTGATTTCAAGCTAGCGGGTTTTCCTAAGTTGGCTGAAGTACGGTTGAGAGCAAAGAAACCTACTGATGGAAGAAAGAAGATTTATTATACAAGGAAAGCATTTGTTGCTTTTGCTATGTCATTTTTGGAGGTCGGAAATCCAAGGTTATTGAGGGGAGTTTTGCAACAGAAGGAGATGTATTCAGGGGTGTTGAGGGGGCTGGGGAGTGATGATGAGGAGACTGTGGTTTATGTTCTGTCAATTTTACGTGATAGCGTGCTTGTTTCAGAGTCCCTGGTGCCTCCAGGCCTTAGAAGTGTGTTGTTTGGGAGTGTTACTTTGGAACAGTTGGTTAGCATTTCAGGGAGGGGAGATTTTAGGGATGCAGCAGAGCTAGCACATCATGTGTTGGTTATGGTGTGTACTAATCCTGTAAATGGATTGATGCCAGATTTGGATAGGCAGCCAAGTCCTCTTCGTGGGAACATGAAGCGGCTTTTGGGTTTAATGAAGAAATTGAAGGCAACAGAAGTTGGGTACCACAAGGGCCTGCTTCTGGCCATTGTGAAAGGACATCCTTCATTTGGTTCGGCATATTTGGATGAGTTCCCTTACAACCTTGAAGATCTTGCATCAGATAACTGGTTTGCTGCTATTTCATTGGCTGCAGTTGTGATTTCGTCAGTCAGTGATGGGCTTTCATTTGGCTTTGCTGACAAACCACCCACATTTGACAATCAACAATTGCAAGATATTCTAAAATGCATAGGACCACGCCCTTTTACTAGATTAGTTATTAACAAAGGGTTACTTCATGCTGATTCTCTTGTGAAACATGGAACATTGAAGCTTATAGTGGAGGTCTTAAAGTTATTGGATTCTTTGATGAAAACTTTGGATAGTTCTTCTCATGCAAACAATCACATGATGCATTGCCAGGAAGCTTTAAAGGCAAACATTCGAAATGGAGTCCGGATGTTGCTTCCTGATCCCCAGGTTTTGCTATCTTTGCTTTCTCCTCTAAATAGCCACTTCAGGAGTCTTGAGTCCTCCACAAAAAGGAAGGCTGAAACAGAAATTTTGCCACATCATTATGTAAGTGGTAGAAAGAGGTTGAAAAGATCTGCTGCAACTGAAGAATTGGATATTCTTATAAGTGGGGTTAATTCTTCTGAGGTAGATTTGTCTGGGGATGGTGGAGTCACAGATTTGGTCTGTGAGCAACAACCAGAGAATGGAGCTGATATTGTGAAATGTATTGGAGATCTTTGGGGCTTACCTGATCTAGAAGATGTGGACGCTTATTTTTACTCCAAGATACTTGATTCTCTTAAAATCTATTATCGGGCCATGCCTACTGCCATGGAAGGATTGTTCGATTTGTTTAAATTTCTACCAAATAATCCTCTAGTGTTACCAACAATTTTGCAGCAGTCCCTGTTAGAACTGCTTAATGAACATGTCAATCAGTTTTCTAAAAGTGTGACCCCCATCAGAACCCCACCACATATGTACAAGCACCTGTGTCCATTTATCATCTTATTAGTGGGGTCTCCAGTCAGAAAGATTAAAGAACATGCTTATGCGTTAGCAAAGGCAGCCATGTTAAGCACTGGTGCATTTGACAATAACACAAATGAAATTTGTGCCTGGTTCTTTTTTATACCTGGTTATAGCAGTGATCGTGTTTACCTTGAAGACTTGAAAGTTGAAATCTTCCAAAAATTGTCGTCAGTCATTGTTTCTTTCCTATGTGATGCTGTTTCCACGACTGGAAATAATTTATACAAGTATATGGAATTCTTGAAGAATTACATCTATGATTCAGAGGATGGTAAAGATCTATCTCCTGAAGTAAGCCCTTTCATTATATGTGTTTTGGAGAAATGTCTACGGTTGCTCGGCTCCGAATCTGGATCCTTTACGATACCTCAGAAGTCATTGATATCACTGTATGTCTGCAACACGCTCAAGTATCTGCTGGATACGCAGGTGAATGCTGGAGCATTATCATTTCTAATTGATCGTGTATTATCGGGGAAGCTTGAGAATTATAGCAGCAGGGTTGATGTATTGGAACTCGTTGAATGCCCATGTGAGTGGAGGCCACTGAAGACTCTATGGCATTTTGCACGTGATATTTTGCGTCAGCAGCATTATAGCATTTATTCCAGTGTTGAGAATTTAGAATCGAATAATTCTCTTATCAATACTCTCAGGGACATTGAAGAAGTTCTGAGGAGTGAGTATGACATTGGAGTTGTTGGATTGACACTTGGATTTTCCTACTCTTTGATGTGCTCAAAACACAATGAGCTATTGCAGAATTTTCCATTAGTCTTATCTATCTCAAGCCACCTACTTGAGGTCCCTTTCATTGTTTTGGCATCTGTATTTTTCCTTGATTCAAGCTATCTCACTGATGTTTCGAGATTATGGCCTGAAATGTTCTCTGCTGCTCTGGACAGAGCCATTCATTGTGAAGAAAAGGAAATGATTTTTGATAAAGTTGATCTTGATTCAACCGAAGCTGCTTCTGATGCGTTTGCTTATTACTTAAAATGTGCTCCATTTTGTGTACTCTTTTCATCTATTGCACAGTGTAGCAGCTTGGATTTACTTCAGCAGCCAACACTTCAAAAGTTGCTTTTGGATAAAATTACTGGAATGCCATCTGATCATTTGATTTCTTCATTATGCAATGTTCTCTTCTGGATTAATCATGCTAGATCATGCTACAAAGTCAGGTCTTCGGAAGAACTTGAGATGCTTTCTGAAATATGCTTTATACTTGCAGAGCACCTGTTGAAAAAATTATTGGTTGAAAATATGGACACTAATAGTGCAGCTGATGTTAAGGATCCTCTAAAGTTACAGTATGCAGTAGAAGTGGCAGAAATCATATTTAATCACCCTGCTGTGACAGCATCACTGAGTTGTCCTTTGTCTGGTAATAAAGAGTTTTCAGATTCAGTCTTTGGAGAAACTCTGGAGAAACTTCTTGTATTAGCTAGGCAGGGAGTTCATGAAATGGATCACCATGTCCTGAATTTGATAAGAACAGTTTCTGAGCTTTTGTTTCCGATGTGTGATGATCAGGTATCTCAACAAGTTTCAAATGACAGAATGCAAATATCAAGAGCATTTAAGGTTCTGGAACGGAAACTGTTTCTGGTATTCAAGAATGAGTTTGATGCATGCATCGAATGCATGGACTTTAAGCTGTTAGTCCCAACCTTTTATGCTTTACACACTTTGATTCATTTCATATCTCCGTTTGAGCTTCTTGGATTGGTGGACTGGTTGTTCGCTCGGATTGATTTCCACAATACAACCTTGCATGTGTCAACAAAAAGAAATGCACTTTTTGTCGTTTTGCACTTAGCCAGTTGTGTTTTTGATTTTCTTTCAGCTTATATGGGGCGGTCATACCCAGAATGTAAACTATATACTCTGGGTGGAACAGAGACACAGTTTGATTCTTTGCTGTTTGAACGGATTTTTTGTCAAGTATTGGAGTTTGGCTTCCATTTTAAATTAGATATTGCTGATACATGTCTGCTCAAAGCTGTCAAGGTTGTAAAAATGCATAATGCCAGTCATTACCCACATCTTCCTTCTATTATGGTCTTATCGCGAGTTATGGCAAGCACCCCAGTAAATATATTCTCTTATTGCTTACACAAGATTGATAGGACAAAAGCTGACTTGTTGTATATTATTGCTGGAATGAACCCCCTGCATATGTCTGTTTTTGGATTTATGTTCTCTGAAGTATTGGATAAATCGTCGTTTCCTAATGCCAATGGTAAGCAAGAAACTTGTAAATACTCTTTTTCTGATGAAGAGCTAGTGATGCTTTTGCCCACTGTCAACTTGTACTTAAACTCAGTTATTTCCAAATATGGGGGACAACTCTGCAAGCCCTTTGAAGTTATAAATTCGGTGTATGGTCGTGTGCTCTTGGATGGTCTTTCTAAGTGGAAGATCTTTGTCTTGGGGAAAAAATTTGAGATTGGAGTTGATGAACCTTCAATTGCATCCACAGAAGAATTTTTGAATCTTTTTTCTGACAGTCTTCTTGCACAGGCAATCGTTATGGTACGGGATTATTTGGCATTAAGTGAAGATACAACAAGGCTTGATAGGAGGTTGAGTTTATTTAATTCTGTTTGTCCATCTAGTGCAGATGATGTTTTTGACTATGGCTATGGTGAGACTGGACTCGATTCGCTTAAACAGCCTTTAGAGTTTGTGAACAGAGTTGTTGCAAAGACAAACTTTTGTATGATGCTACTATTTTCGGATCATAATCCCAGTCATTCTCAGCTGGATAATGAAAATAAAGATGTGGTTTCTCTCCAAGTTACCTCTGACATAGAGAAGTCAAGAGTTCGCTTTTTAAGGATGTTGATTAATTCCTGGATGTTGATTGTCAAGAAATTCCCGGAGAATATTGATCTCTCTGGAAACATTGATGGCCAGAATATTTCATTGTTCAGATTTCTGGAAATCTTTGTAATGAA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|
Protein: MEEKEEQDLPEFTIRMNHEAKLKELLRNLNSVESQLFSDACKEFIKILKSDSGPQFIRIYVQTSSKLVEISQAWEFRKGKPGFLHILNLVASVLKHWKDNVVSDGGVAIRQALDRFARTVFEEKMGDLYKELNSKEAKRQNAVLLLLASIVRRNSHLAWEVAKVFDFKLAGFPKLAEVRLRAKKPTDGRKKIYYTRKAFVAFAMSFLEVGNPRLLRGVLQQKEMYSGVLRGLGSDDEETVVYVLSILRDSVLVSESLVPPGLRSVLFGSVTLEQLVSISGRGDFRDAAELAHHVLVMVCTNPVNGLMPDLDRQPSPLRGNMKRLLGLMKKLKATEVGYHKGLLLAIVKGHPSFGSAYLDEFPYNLEDLASDNWFAAISLAAVVISSVSDGLSFGFADKPPTFDNQQLQDILKCIGPRPFTRLVINKGLLHADSLVKHGTLKLIVEVLKLLDSLMKTLDSSSHANNHMMHCQEALKANIRNGVRMLLPDPQVLLSLLSPLNSHFRSLESSTKRKAETEILPHHYVSGRKRLKRSAATEELDILISGVNSSEVDLSGDGGVTDLVCEQQPENGADIVKCIGDLWGLPDLEDVDAYFYSKILDSLKIYYRAMPTAMEGLFDLFKFLPNNPLVLPTILQQSLLELLNEHVNQFSKSVTPIRTPPHMYKHLCPFIILLVGSPVRKIKEHAYALAKAAMLSTGAFDNNTNEICAWFFFIPGYSSDRVYLEDLKVEIFQKLSSVIVSFLCDAVSTTGNNLYKYMEFLKNYIYDSEDGKDLSPEVSPFIICVLEKCLRLLGSESGSFTIPQKSLISLYVCNTLKYLLDTQVNAGALSFLIDRVLSGKLENYSSRVDVLELVECPCEWRPLKTLWHFARDILRQQHYSIYSSVENLESNNSLINTLRDIEEVLRSEYDIGVVGLTLGFSYSLMCSKHNELLQNFPLVLSISSHLLEVPFIVLASVFFLDSSYLTDVSRLWPEMFSAALDRAIHCEEKEMIFDKVDLDSTEAASDAFAYYLKCAPFCVLFSSIAQCSSLDLLQQPTLQKLLLDKITGMPSDHLISSLCNVLFWINHARSCYKVRSSEELEMLSEICFILAEHLLKKLLVENMDTNSAADVKDPLKLQYAVEVAEIIFNHPAVTASLSCPLSGNKEFSDSVFGETLEKLLVLARQGVHEMDHHVLNLIRTVSELLFPMCDDQVSQQVSNDRMQISRAFKVLERKLFLVFKNEFDACIECMDFKLLVPTFYALHTLIHFISPFELLGLVDWLFARIDFHNTTLHVSTKRNALFVVLHLASCVFDFLSAYMGRSYPECKLYTLGGTETQFDSLLFERIFCQVLEFGFHFKLDIADTCLLKAVKVVKMHNASHYPHLPSIMVLSRVMASTPVNIFSYCLHKIDRTKADLLYIIAGMNPLHMSVFGFMFSEVLDKSSFPNANGKQETCKYSFSDEELVMLLPTVNLYLNSVISKYGGQLCKPFEVINSVYGRVLLDGLSKWKIFVLGKKFEIGVDEPSIASTEEFLNLFSDSLLAQAIVMVRDYLALSEDTTRLDRRLSLFNSVCPSSADDVFDYGYGETGLDSLKQPLEFVNRVVAKTNFCMMLLFSDHNPSHSQLDNENKDVVSLQVTSDIEKSRVRFLRMLINSWMLIVKKFPENIDLSGNIDGQNISLFRFLEIFVMNNILDLTTEIHDRLVKLDSLPFIEQLVRAFLLYRFGDLATLKKLRSILTSLSHEKFSCASVIQLLLAHSQFAQSFHLACSSLVSTQFGMVFTPMRSILRSLVIPCTDLDTMNCESYKLTSQQHPRLLELIKLVRVLIHIYVQQREANLGEDTGINSKELLYLLLSSYGATCTEIDLEIYNLILEIESNDKSSAGTVAEMDYLWGIASLKVRKDWEQDKDMQSVDPKNIEFFEEHRKIKFRENFPVDPKLCAQTVLYFPYNRSVNEGTLHRLQKDCSTVVHEAQATTDKQQVYDPVFILRFSIHCLSMSYVEPIEFATSGLLAVTFASVSSPDVDMRKLGYEALAKFKSALEKCQKKKDVVRLRLLVSYLQNGIEEPWQRIPSIIAVFIAEASMVLLDPSHDNYSTISKYLTNSPSVNVKAIPLFQNLFWSSSITFRADRLWMLRILYVGLNMEDDAQIYIRNSIFETLMSFYSSPLSDNDSKDLIIQIVKKAVQLRKAVWFLVEHCGLILWLSSIVSSLYGESHDRKNVALTQLPIILEKILIATPSVQVF |